【第6回】ゼロから始めるゲノム解析（R編）

機能改善イベント編集時の「重複参加の許可」をデフォルトで「許可しない」から「許可する」に変更しました。詳しくはこちらをご確認ください

お知らせ connpassアカウントのパスワードを設定することで、ソーシャル認証に依存しないログインも可能となります。詳しくは以下のヘルプをご確認ください。
- パスワードの設定
- ソーシャル認証ログインが出来なくなった場合の操作
イベント管理者様・グループ管理者様も上記ヘルプを一括メッセージ機能にて参加者・グループメンバーへ案内して、連絡がつかなくならないようご注意ください。

Dec

4
【第6回】ゼロから始めるゲノム解析（R編）
Computational Genomics with R

Organizing : Bioinformatics Tokyo

Hashtag ：#BioinformaticsTokyo

Registration info	参加枠 Free FCFS 47/47 発表枠（前半） Free FCFS 1/1 発表枠（後半） Free FCFS 1/1 発表枠（LT） Free FCFS 0/1

Description

概要

バイオインフォマティクス、計算生物学、システムバイオロジーなどに興味のある方に向けた勉強会です。

ゼロから始めるゲノム解析ではCreative Commonsで公開されているComputational Genomics with Rの資料を日本語で説明し、Rでゲノム解析ができるようになるために実践的に学びます。

予習は必要ありませんが、予習して来ていただけると運営が喜びます。

発表枠について

今回はChapterを分割してみましたので、発表を担当したい方は発表枠の前半か後半でお申込みください。

ライトニングトーク枠について

講義の最後にライトニングトーク枠を設けています。
ゲノミクス関連・バイオインフォマティクス関連・データ分析関連であれば何でも構いません。
バイオインフォマティクスに興味のある方へ発信したい内容がある方は是非ご登壇頂けますと幸いです。

資料の構成

Chapter 1: Introduction to Genomics
Chapter 2: Introduction to R for Genomic Data Analysis
Chapter 3: Statistics for Genomics
Chapter 4: Exploratory Data Analysis with Unsupervised Machine Learning
Chapter 5: Predictive Modeling with Supervised Machine Learning
Chapter 6: Operations on Genomic Intervals and Genome Arithmetic 👈 今回はココ！！
Chapter 7: Quality Check, Processing and Alignment of High-throughput Sequencing Reads
Chapter 8: RNA-seq Analysis
Chapter 9: ChIP-seq analysis
Chapter 10: DNA methylation analysis using bisulfite sequencing data
Chapter 11: Multi-omics Analysis

スケジュール

時間	内容
19:00-19:05	イントロダクション
19:05-19:30	前半 6.1 Operations on genomic intervals with GenomicRanges package 6.2 Dealing with mapped high-throughput sequencing reads 6.3 Dealing with continuous scores over the genome
19:30-19:55	後半 6.4 Genomic intervals with more information 6.5 Visualizing and summarizing genomic intervals
19:55-20:00	ライトニングトーク