【第7回】ゼロから始めるゲノム解析（R編）

お知らせ connpassではさらなる価値のあるデータを提供するため、2024年5月23日(木)を以ちましてイベントサーチAPIの無料での提供の廃止を決定いたしました。
2024年5月23日(木)以降より開始予定の「connpass 有料API」の料金プランにつきましてはこちらをご覧ください。
なお有料の対象となるのはAPIのみであり、connpassのサービスにつきましては今後も無料でご利用いただけます。

12月

18
【第7回】ゼロから始めるゲノム解析（R編）
Computational Genomics with R

主催 : Bioinformatics Tokyo

ハッシュタグ：#BioinformaticsTokyo

募集内容	参加枠無料先着順 41/47人発表枠（前半）無料先着順 1/1人発表枠（後半）無料先着順 0/1人発表枠（LT）無料先着順 1/1人
申込者	申込者一覧を見る
開催日時	2020/12/18(金) 19:00 ～ 20:00 Googleカレンダー icsファイル
募集期間	2020/12/10(木) 14:40 〜 2020/12/18(金) 20:00まで
会場	Meet

イベントの説明

概要

バイオインフォマティクス、計算生物学、システムバイオロジーなどに興味のある方に向けた勉強会です。

ゼロから始めるゲノム解析ではCreative Commonsで公開されているComputational Genomics with Rの資料を日本語で説明し、Rでゲノム解析ができるようになるために実践的に学びます。

予習は必要ありませんが、予習して来ていただけると運営が喜びます。

発表枠について

今回はChapterを分割してみましたので、発表を担当したい方は発表枠の前半か後半でお申込みください。

ライトニングトーク枠について

講義の途中にライトニングトーク枠を設けています。
ゲノミクス関連・バイオインフォマティクス関連・データ分析関連であれば何でも構いません。
バイオインフォマティクスに興味のある方へ発信したい内容がある方は是非ご登壇頂けますと幸いです。

資料の構成

Chapter 1: Introduction to Genomics
Chapter 2: Introduction to R for Genomic Data Analysis
Chapter 3: Statistics for Genomics
Chapter 4: Exploratory Data Analysis with Unsupervised Machine Learning
Chapter 5: Predictive Modeling with Supervised Machine Learning
Chapter 6: Operations on Genomic Intervals and Genome Arithmetic
Chapter 7: Quality Check, Processing and Alignment of High-throughput Sequencing Reads 👈 今回はココ！！
Chapter 8: RNA-seq Analysis
Chapter 9: ChIP-seq analysis
Chapter 10: DNA methylation analysis using bisulfite sequencing data
Chapter 11: Multi-omics Analysis

スケジュール

時間	内容
19:00-19:05	イントロダクション
19:05-19:30	前半 7.1 FASTA and FASTQ formats 7.2 Quality check on sequencing reads
19:30-19:35	休憩（ライトニングトーク）
19:35-20:00	後半 7.3 Filtering and trimming reads 7.4 Mapping/aligning reads to the genome 7.5 Further processing of aligned reads