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Dec

18

【第7回】ゼロから始めるゲノム解析(R編)

Computational Genomics with R

Organizing : Bioinformatics Tokyo

【第7回】ゼロから始めるゲノム解析(R編)
Registration info

参加枠

Free

FCFS
41/47

発表枠(前半)

Free

FCFS
1/1

発表枠(後半)

Free

FCFS
0/1

発表枠(LT)

Free

FCFS
1/1

Attendees
t.nishiyama
urakiyonobu
340
su3su3su3
hosokawah
ancoro81
ktkoba2020
kikurage1001
RKuwahara
mskpum
View Attendee List
Start Date
2020/12/18(Fri) 19:00 ~ 20:00
Registration Period

2020/12/10(Thu) 14:40 〜
2020/12/18(Fri) 20:00まで

Location

Meet

Description

概要

バイオインフォマティクス、計算生物学、システムバイオロジーなどに興味のある方に向けた勉強会です。

ゼロから始めるゲノム解析ではCreative Commonsで公開されているComputational Genomics with Rの資料を日本語で説明し、Rでゲノム解析ができるようになるために実践的に学びます。

予習は必要ありませんが、予習して来ていただけると運営が喜びます。

発表枠について

今回はChapterを分割してみましたので、発表を担当したい方は発表枠の前半か後半でお申込みください。

ライトニングトーク枠について

講義の途中にライトニングトーク枠を設けています。
ゲノミクス関連・バイオインフォマティクス関連・データ分析関連であれば何でも構いません。
バイオインフォマティクスに興味のある方へ発信したい内容がある方は是非ご登壇頂けますと幸いです。

資料の構成

  • Chapter 1: Introduction to Genomics
  • Chapter 2: Introduction to R for Genomic Data Analysis
  • Chapter 3: Statistics for Genomics
  • Chapter 4: Exploratory Data Analysis with Unsupervised Machine Learning
  • Chapter 5: Predictive Modeling with Supervised Machine Learning
  • Chapter 6: Operations on Genomic Intervals and Genome Arithmetic
  • Chapter 7: Quality Check, Processing and Alignment of High-throughput Sequencing Reads 👈 今回はココ!!
  • Chapter 8: RNA-seq Analysis
  • Chapter 9: ChIP-seq analysis
  • Chapter 10: DNA methylation analysis using bisulfite sequencing data
  • Chapter 11: Multi-omics Analysis

スケジュール

時間 内容
19:00-19:05 イントロダクション
19:05-19:30 前半
7.1 FASTA and FASTQ formats
7.2 Quality check on sequencing reads
19:30-19:35 休憩(ライトニングトーク)
19:35-20:00 後半
7.3 Filtering and trimming reads
7.4 Mapping/aligning reads to the genome
7.5 Further processing of aligned reads

実施方法

当日はGoogle Meetを使用します。URLは参加者に事前に通知いたします。

参加費

無料

Feed

kimoton

kimotonさんが資料をアップしました。

12/18/2020 20:16

kimoton

kimoton published 【第7回】ゼロから始めるゲノム解析(R編).

12/10/2020 14:41

【第7回】ゼロから始めるゲノム解析(R編) を公開しました!今回はシーケンスデータのQC、マッピング/アライメントを扱います!

Group

Bioinformatics Tokyo

Number of events 31

Members 297

Ended

2020/12/18(Fri)

19:00
20:00

Registration Period
2020/12/10(Thu) 14:40 〜
2020/12/18(Fri) 20:00

Location

Meet

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Organizer

Attendees(43)

t.nishiyama

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