【第7回】ゼロから始めるゲノム解析（R編）

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- パスワードの設定
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Dec

18
【第7回】ゼロから始めるゲノム解析（R編）
Computational Genomics with R

Organizing : Bioinformatics Tokyo

Hashtag ：#BioinformaticsTokyo

Registration info	参加枠 Free FCFS 41/47 発表枠（前半） Free FCFS 1/1 発表枠（後半） Free FCFS 0/1 発表枠（LT） Free FCFS 1/1

Description

概要

バイオインフォマティクス、計算生物学、システムバイオロジーなどに興味のある方に向けた勉強会です。

ゼロから始めるゲノム解析ではCreative Commonsで公開されているComputational Genomics with Rの資料を日本語で説明し、Rでゲノム解析ができるようになるために実践的に学びます。

予習は必要ありませんが、予習して来ていただけると運営が喜びます。

発表枠について

今回はChapterを分割してみましたので、発表を担当したい方は発表枠の前半か後半でお申込みください。

ライトニングトーク枠について

講義の途中にライトニングトーク枠を設けています。
ゲノミクス関連・バイオインフォマティクス関連・データ分析関連であれば何でも構いません。
バイオインフォマティクスに興味のある方へ発信したい内容がある方は是非ご登壇頂けますと幸いです。

資料の構成

Chapter 1: Introduction to Genomics
Chapter 2: Introduction to R for Genomic Data Analysis
Chapter 3: Statistics for Genomics
Chapter 4: Exploratory Data Analysis with Unsupervised Machine Learning
Chapter 5: Predictive Modeling with Supervised Machine Learning
Chapter 6: Operations on Genomic Intervals and Genome Arithmetic
Chapter 7: Quality Check, Processing and Alignment of High-throughput Sequencing Reads 👈 今回はココ！！
Chapter 8: RNA-seq Analysis
Chapter 9: ChIP-seq analysis
Chapter 10: DNA methylation analysis using bisulfite sequencing data
Chapter 11: Multi-omics Analysis

スケジュール

時間	内容
19:00-19:05	イントロダクション
19:05-19:30	前半 7.1 FASTA and FASTQ formats 7.2 Quality check on sequencing reads
19:30-19:35	休憩（ライトニングトーク）
19:35-20:00	後半 7.3 Filtering and trimming reads 7.4 Mapping/aligning reads to the genome 7.5 Further processing of aligned reads