このエントリーをはてなブックマークに追加

Jan

22

【第9回】ゼロから始めるゲノム解析(R編)

Computational Genomics with R

Organizing : Bioinformatics Tokyo

Registration info

参加枠

Free

FCFS
43/48

発表枠

Free

FCFS
1/1

LT枠

Free

FCFS
1/1

Description

勉強会の概要

バイオインフォマティクス、計算生物学、システムバイオロジーなどに興味のある方に向けた勉強会です。

ゼロから始めるゲノム解析ではCreative Commonsで公開されているComputational Genomics with Rの資料を日本語で説明し、Rでゲノム解析ができるようになるために実践的に学びます。

予習は必要ありませんが、予習して来ていただけると運営が喜びます。

発表枠とLT枠について

発表を担当したい方は発表枠でお申込みください。

勉強会の最後にライトニングトーク(LT)枠を設けています。
ゲノミクス関連・バイオインフォマティクス関連・データ分析関連であれば何でも構いません。
バイオインフォマティクスに興味のある方へ発信したい内容がある方は是非ご登壇頂けますと幸いです。

資料の構成

  • Chapter 1: Introduction to Genomics
  • Chapter 2: Introduction to R for Genomic Data Analysis
  • Chapter 3: Statistics for Genomics
  • Chapter 4: Exploratory Data Analysis with Unsupervised Machine Learning
  • Chapter 5: Predictive Modeling with Supervised Machine Learning
  • Chapter 6: Operations on Genomic Intervals and Genome Arithmetic
  • Chapter 7: Quality Check, Processing and Alignment of High-throughput Sequencing Reads
  • Chapter 8: RNA-seq Analysis
  • Chapter 9: ChIP-seq analysis 👈 今回はココ!!
  • Chapter 10: DNA methylation analysis using bisulfite sequencing data
  • Chapter 11: Multi-omics Analysis

スケジュール

時間 内容
19:00-19:05 イントロダクション
19:05-19:55 ChIP-seq Analysis 
19:55-20:00 LT(Modern Statistics for Modern Biology の紹介)

実施方法

当日はGoogle Meetを使用します。URLは参加者に事前に通知いたします。

参加費

無料

発表者

Feed

Naoto Imamachi

Naoto Imamachi wrote a comment.

2021/01/27 22:52

遅くなりましたが、資料をアップロードしました。

Naoto Imamachi

Naoto Imamachiさんが資料をアップしました。

01/27/2021 22:51

kozo2

kozo2さんが資料をアップしました。

01/22/2021 13:46

kozo2

kozo2 wrote a comment.

2021/01/21 19:34

LTのタイトルの変更をお願いします「Modern Statistics for Modern Biology の紹介」でお願いします

Naoto Imamachi

Naoto Imamachi wrote a comment.

2021/01/20 23:10

今回分の R コードをまとめた Jupyter Notebook を用意しました。参考までにどうぞ。

Naoto Imamachi

Naoto Imamachiさんが資料をアップしました。

01/20/2021 23:08

Naoto Imamachi

Naoto Imamachiさんが資料をアップしました。

01/20/2021 23:06

kozo2

kozo2 wrote a comment.

2021/01/12 19:20

LTのタイトルは「the Orchestra platform: http://app.orchestra.cancerdatasci.org の紹介」でお願いします

onouyek

onouyek published 【第9回】ゼロから始めるゲノム解析(R編).

01/12/2021 18:00

【第9回】ゼロから始めるゲノム解析(R編) を公開しました!

Group

Bioinformatics Tokyo

Number of events 17

Members 236

Ended

2021/01/22(Fri)

19:00
20:00

You cannot RSVP if you are already participating in another event at the same date.

Registration Period
2021/01/12(Tue) 18:00 〜
2021/01/22(Fri) 19:00

Location

Meet

Meet

Organizer

Attendees(45)

yoshitaka

yoshitaka

【第9回】ゼロから始めるゲノム解析(R編)に参加を申し込みました!

kansaka

kansaka

【第9回】ゼロから始めるゲノム解析(R編)に参加を申し込みました!

su3su3su3

su3su3su3

【第9回】ゼロから始めるゲノム解析(R編)に参加を申し込みました!

t.nishiyama

t.nishiyama

【第9回】ゼロから始めるゲノム解析(R編)に参加を申し込みました!

yaza_ta

yaza_ta

【第9回】ゼロから始めるゲノム解析(R編)に参加を申し込みました!

RKuwahara

RKuwahara

【第9回】ゼロから始めるゲノム解析(R編) に参加を申し込みました!

ma31stm

ma31stm

【第9回】ゼロから始めるゲノム解析(R編)に参加を申し込みました!

Usyarku

Usyarku

【第9回】ゼロから始めるゲノム解析(R編)に参加を申し込みました!

Yoshi/酸化物理神経糖脂

Yoshi/酸化物理神経糖脂

【第9回】ゼロから始めるゲノム解析(R編) に参加を申し込みました!

yasutakakuniyoshi

yasutakakuniyoshi

【第9回】ゼロから始めるゲノム解析(R編)に参加を申し込みました!

Attendees (45)

Canceled (1)